中医针灸师证书的颁发主要由中国中医药管理局主管，各省、自治区、直辖市中医药管理部门负责具体实施，有多个机构和学校可以提供中医针灸师的专业培训和考核，以便培养合格的针灸师，以下是一些主要的颁发机构：

1、中国中医药管理局：作为国家级的中医药管理部门，中国中医药管理局负责制定中医针灸师的培训大纲、考试大纲和证书标准，在全国各地设立了多个中医药考试中心，负责组织中医针灸师的考试和证书颁发工作。

2、各省、自治区、直辖市中医药管理部门：各省、自治区、直辖市中医药管理部门在国家中医药管理局的指导下，负责本地区的中医针灸师培训和考试工作，各地设有专门的中医药考试中心，负责组织本地区的中医针灸师考试和证书颁发工作。

3、中国中医科学院针灸研究所：中国中医科学院针灸研究所是国内著名的针灸科研机构，具有丰富的针灸教学和研究经验，该所负责组织全国性的中医针灸师培训班，为学员提供专业的培训和指导。

4、各省、自治区、直辖市中医药高等院校：各省、自治区、直辖市的中医药高等院校也设有针灸专业，负责为本地区培养合格的中医针灸师，这些学校的针灸专业通常与附属医院或临床医学院合作，为学生提供实践操作的机会。

5、其他培训机构：除了上述主要的颁发机构外，还有一些专门从事中医针灸师培训的培训机构，这些机构通常会与企事业单位、社区卫生服务中心等合作，为学员提供灵活的学习方式和就业机会。

中医针灸师证书的颁发涉及多个部门和机构，需要经过严格的培训和考核才能获得，在选择学习中医针灸的学校或机构时，建议考生充分了解相关政策和规定，选择具有良好师资和教学条件的正规学校或机构进行学习，考生还需关注国家和地方政策的变化，及时调整自己的学习和职业规划。