口腔保健师证发证机构是指负责颁发口腔保健师资格证书的官方机构，口腔保健师证发证机构主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)下属的职业技能鉴定指导中心、各地人力资源和社会保障局等单位负责，这些机构负责组织口腔保健师的考试、培训和证书颁发工作，以确保口腔保健师的专业素质和技能水平。
国家卫生健康委员会(原卫生部)下属的职业技能鉴定指导中心是口腔保健师证发证机构的重要组成部分，该中心负责制定口腔保健师职业技能鉴定标准和考试大纲，组织实施口腔保健师职业技能鉴定工作，对合格人员颁发口腔保健师资格证书，该中心还负责对口腔保健师培训机构进行监督和指导，确保培训质量。
各地人力资源和社会保障局也是口腔保健师证发证机构的一部分，在各省、自治区、直辖市设立有人力资源和社会保障局的地方，这些局负责本地区的口腔保健师证书颁发工作，他们需要与职业技能鉴定指导中心密切合作，按照国家统一的标准和要求，对考生进行资格审查、考试组织和成绩统计等工作，最后将合格人员的名单报送给职业技能鉴定指导中心，由其颁发证书。
一些专业的口腔医学院校和职业技术学院也承担着口腔保健师证发证机构的部分职责，这些学校通过开设相关专业课程和培训项目，培养具有一定理论和实践能力的口腔保健师人才，在学校完成学业并通过考核的学生，可以获得学校颁发的结业证书或学位证书，这些学校的结业证书或学位证书在一定程度上也具有职业资格证书的作用，但其权威性和认可度相对较低。
口腔保健师证发证机构主要包括国家卫生健康委员会(原卫生部)下属的职业技能鉴定指导中心、各地人力资源和社会保障局以及专业的口腔医学院校和职业技术学院等，这些机构共同构成了中国口腔保健师证书颁发体系，为广大人民群众提供专业、规范的口腔保健服务提供了有力保障。
