南阳厨师证的发放部门主要有两个，分别是南阳市人力资源和社会保障局和南阳市商务局，这两个部门都有各自的发放标准和流程，但是在实际操作中，很多人会选择去南阳市人力资源和社会保障局办理。

南阳市人力资源和社会保障局是负责职业技能鉴定的部门，其颁发的证书具有较高的权威性和认可度，该部门的办理流程相对简单，只需要提供相关材料并缴纳一定的费用即可，该部门还会为学员提供一定的培训课程，帮助他们提高自己的技能水平。

南阳市商务局也是一个可以颁发厨师证的部门，但其颁发的证书相对较少见，如果您想要获得这个证书，需要先参加商务局组织的考试并通过后方可获得，不过需要注意的是，商务局颁发的证书可能在一些场合下并不被认可。

如果您想要获得南阳厨师证，建议选择南阳市人力资源和社会保障局进行办理，具体选择哪个部门还需要根据您自身的情况来决定。