中科院心理咨询师证书是国家职业资格证书，属于职业技能等级认证体系，根据《中华人民共和国职业技能等级评价办法》规定，职业技能等级分为五个等级，由低到高分别为：初级、中级、高级、技师和高级技师，中科院心理咨询师证书的等级应该在这三个等级之间。

中科院心理咨询师证书的等级应该是中级或者高级，因为中科院心理咨询师证书是由中国科学院心理研究所颁发的，而中国科学院心理研究所是国内权威的心理研究机构之一，其颁发的证书具有很高的权威性和可信度，中科院心理咨询师证书考试难度较大，通过率较低，这也说明了该证书的含金量较高。