心理咨询师证是由国家人力资源和社会保障部颁发的，是国家职业资格证书之一，根据《中华人民共和国职业技能鉴定法》和《职业技能鉴定实施办法》，职业技能鉴定分为职业资格认证和职业技能等级认定两种形式，职业资格认证是指对劳动者所从事的某一职业所需的专业知识、技能和素质进行评估，以证明其具备从事该职业的基本能力；而职业技能等级认定则是对劳动者在某一职业中所达到的技术水平进行评估，以确定其在该职业中的等级地位。

目前，国内心理咨询师证书主要由人力资源和社会保障部颁发，各省市也会根据自身情况设立相应的心理咨询师考试机构，如北京市心理咨询师考试中心、上海市心理咨询师考试中心等，这些机构负责组织和管理当地的心理咨询师考试工作，包括报名、资格审查、考试安排、成绩发布等环节。

在实际应用中，不同部门颁发的心理咨询师证书并没有太大的区别，无论是由人力资源和社会保障部颁发还是由各省市自行设立的考试机构颁发，只要是符合国家规定的条件并通过考试获得的证书，都具有同等的法律效力和行业认可度，选择哪个部门颁发的心理咨询师证书更多的可能是取决于个人所在地区的情况以及个人对不同部门之间差异的认识和了解程度。