健康管理师证书的发证机关是指负责颁发健康管理师资格证书的政府部门或机构，健康管理师证书的发证机关主要有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部):作为中国政府部门中主管卫生健康工作的部门，国家卫生健康委员会负责制定和发布健康管理师的相关政策、法规和标准，对健康管理师的培训、考试和发证工作进行监督和管理。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：在国家卫生健康委员会的指导下，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会负责本辖区内健康管理师的培训、考试和发证工作，各级卫生健康委员会会定期组织健康管理师的考试，合格者颁发相应的资格证书。

3、人力资源社会保障部：人力资源社会保障部是中国政府部门中主管人力资源和社会保障工作的部门，负责制定和发布与人力资源管理相关的政策、法规和标准，虽然人力资源社会保障部并非直接负责健康管理师证书的发证工作，但其参与制定的相关政策和标准可能会影响到健康管理师证书的颁发和管理。

4、专业培训机构：为了满足社会对健康管理师的需求，各地还设有专门的健康管理师培训机构，这些培训机构负责组织健康管理师的培训课程，帮助学员掌握相关知识和技能，在完成培训后，学员需要参加由卫生健康委员会等相关部门组织的考试，合格者可获得健康管理师证书。

5、其他相关机构：除了上述主要的发证机关外，还有一些其他机构也会参与健康管理师证书的颁发工作，一些行业协会、学会等组织可能会协助卫生健康委员会等发证机关开展健康管理师的培训和考试工作，部分企事业单位、高等院校等也会自行设立健康管理师的培训和考核体系，发放相应的证书。

健康管理师证书的发证机关主要包括国家卫生健康委员会、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、人力资源社会保障部以及其他相关机构，这些发证机关共同负责制定和执行健康管理师的相关政策、法规和标准，确保健康管理师的专业素质和能力得到有效保障，各类培训机构、企事业单位等也在健康管理师证书的颁发和管理过程中发挥着重要作用。