健康管理师证书上的章子数量因证书类型而异，在2020年进行了证书改革之前，健康管理师一直是全国统考的，每年4月、7月、11月组织考试，发证的机关就是国家卫健委和人社部，所以这一版证书上面会盖着两个章，一个是卫健委的章，一个是人社部的章。

而在2020年进行的证书改革后，健康管理师证书分为两种：一种是由国家卫生健康委员会颁发的“全国卫生行业职业技能鉴定合格证书”，另一种是由各省市人力资源和社会保障局颁发的“职业资格证书”，这两种证书上面的章子数量也不同，全国卫生行业职业技能鉴定合格证书上面只会盖一个章子，即国家卫生健康委员会的章；而职业资格证书上面则会盖两个章子，分别是省级人力资源和社会保障局和国家卫生健康委员会的章 。